Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMF1P82094 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMF1P82094 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMF1P82094 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMF1P82094 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMF1P82094 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMF1P82094 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMF1P82094 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TMF1P82094 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TMF1P82094 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TMF1P82094 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TMF1P82094 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TMF1P82094 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TMF1P82094 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TMF1P82094 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TMF1P82094 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TMF1P82094 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TMF1P82094 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMF1P82094 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMF1P82094 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMF1P82094 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMF1P82094 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMF1P82094 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMF1P82094 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMF1P82094 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMF1P82094 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMF1P82094 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMF1P82094 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMF1P82094 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TMF1P82094 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TMF1P82094 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TMF1P82094 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TMF1P82094 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
TMF1P82094 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TMF1P82094 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TMF1P82094 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TMF1P82094 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TMF1P82094 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TMF1P82094 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TMF1P82094 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TMF1P82094 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TMF1P82094 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TMF1P82094 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TMF1P82094 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TMF1P82094 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TMF1P82094 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TMF1P82094 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TMF1P82094 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TMF1P82094 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TMF1P82094 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TMF1P82094 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TMF1P82094 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TMF1P82094 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TMF1P82094 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TMF1P82094 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMF1P82094 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMF1P82094 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMF1P82094 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMF1P82094 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMF1P82094 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMF1P82094 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMF1P82094 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMF1P82094 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMF1P82094 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMF1P82094 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMF1P82094 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMF1P82094 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMF1P82094 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMF1P82094 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMF1P82094 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TMF1P82094 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TMF1P82094 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TMF1P82094 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TMF1P82094 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TMF1P82094 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TMF1P82094 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TMF1P82094 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TMF1P82094 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TMF1P82094 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TMF1P82094 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
TMF1P82094 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TMF1P82094 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TMF1P82094 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TMF1P82094 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TMF1P82094 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TMF1P82094 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TMF1P82094 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TMF1P82094 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TMF1P82094 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TMF1P82094 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMF1P82094 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMF1P82094 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMF1P82094 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMF1P82094 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMF1P82094 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMF1P82094 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMF1P82094 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMF1P82094 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMF1P82094 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMF1P82094 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms