Protein–RNA interactions for Protein: P68036

UBE2L3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2L3P68036 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2L3P68036 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2L3P68036 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms