Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNRPEP62304 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNRPEP62304 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNRPEP62304 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNRPEP62304 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNRPEP62304 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNRPEP62304 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNRPEP62304 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SNRPEP62304 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms