Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVFC1-1P60608 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms