Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms