Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSE1LP55060 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms