Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP2S1P53680 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP2S1P53680 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms