Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK7P50613 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK7P50613 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK7P50613 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK7P50613 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK7P50613 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK7P50613 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK7P50613 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK7P50613 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK7P50613 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK7P50613 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK7P50613 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK7P50613 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK7P50613 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK7P50613 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK7P50613 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK7P50613 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK7P50613 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK7P50613 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK7P50613 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK7P50613 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK7P50613 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK7P50613 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK7P50613 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK7P50613 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK7P50613 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK7P50613 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK7P50613 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK7P50613 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK7P50613 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK7P50613 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK7P50613 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK7P50613 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK7P50613 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK7P50613 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK7P50613 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK7P50613 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK7P50613 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK7P50613 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK7P50613 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK7P50613 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK7P50613 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK7P50613 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK7P50613 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK7P50613 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK7P50613 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK7P50613 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK7P50613 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK7P50613 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK7P50613 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK7P50613 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK7P50613 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK7P50613 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK7P50613 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK7P50613 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK7P50613 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK7P50613 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK7P50613 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK7P50613 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK7P50613 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK7P50613 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK7P50613 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK7P50613 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK7P50613 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK7P50613 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK7P50613 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK7P50613 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK7P50613 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK7P50613 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK7P50613 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK7P50613 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK7P50613 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK7P50613 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK7P50613 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK7P50613 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK7P50613 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK7P50613 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK7P50613 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK7P50613 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK7P50613 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK7P50613 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK7P50613 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK7P50613 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK7P50613 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK7P50613 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK7P50613 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK7P50613 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK7P50613 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK7P50613 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK7P50613 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK7P50613 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK7P50613 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK7P50613 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK7P50613 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK7P50613 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK7P50613 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK7P50613 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK7P50613 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK7P50613 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK7P50613 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms