Protein–RNA interactions for Protein: P49189

ALDH9A1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH9A1P49189 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALDH9A1P49189 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALDH9A1P49189 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms