Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECI1P42126 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECI1P42126 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECI1P42126 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECI1P42126 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECI1P42126 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECI1P42126 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECI1P42126 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECI1P42126 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ECI1P42126 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECI1P42126 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECI1P42126 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECI1P42126 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECI1P42126 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECI1P42126 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECI1P42126 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECI1P42126 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECI1P42126 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECI1P42126 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECI1P42126 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECI1P42126 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECI1P42126 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECI1P42126 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECI1P42126 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECI1P42126 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECI1P42126 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ECI1P42126 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ECI1P42126 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ECI1P42126 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ECI1P42126 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ECI1P42126 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ECI1P42126 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ECI1P42126 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ECI1P42126 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ECI1P42126 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ECI1P42126 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ECI1P42126 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ECI1P42126 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ECI1P42126 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECI1P42126 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECI1P42126 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECI1P42126 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECI1P42126 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECI1P42126 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECI1P42126 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECI1P42126 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECI1P42126 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECI1P42126 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECI1P42126 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECI1P42126 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECI1P42126 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECI1P42126 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECI1P42126 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECI1P42126 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECI1P42126 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECI1P42126 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECI1P42126 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECI1P42126 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECI1P42126 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECI1P42126 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECI1P42126 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ECI1P42126 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ECI1P42126 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ECI1P42126 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ECI1P42126 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ECI1P42126 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ECI1P42126 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ECI1P42126 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ECI1P42126 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ECI1P42126 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ECI1P42126 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ECI1P42126 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ECI1P42126 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ECI1P42126 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ECI1P42126 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ECI1P42126 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ECI1P42126 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ECI1P42126 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ECI1P42126 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ECI1P42126 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECI1P42126 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECI1P42126 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ECI1P42126 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECI1P42126 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECI1P42126 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECI1P42126 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECI1P42126 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECI1P42126 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECI1P42126 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECI1P42126 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECI1P42126 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECI1P42126 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECI1P42126 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECI1P42126 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECI1P42126 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECI1P42126 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECI1P42126 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECI1P42126 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECI1P42126 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECI1P42126 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.3 ms