Protein–RNA interactions for Protein: P35367

HRH1, Histamine H1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRH1P35367 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HRH1P35367 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HRH1P35367 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HRH1P35367 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HRH1P35367 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HRH1P35367 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HRH1P35367 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HRH1P35367 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HRH1P35367 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HRH1P35367 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HRH1P35367 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HRH1P35367 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HRH1P35367 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HRH1P35367 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HRH1P35367 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HRH1P35367 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HRH1P35367 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HRH1P35367 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HRH1P35367 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HRH1P35367 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HRH1P35367 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HRH1P35367 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HRH1P35367 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HRH1P35367 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HRH1P35367 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HRH1P35367 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HRH1P35367 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HRH1P35367 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HRH1P35367 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HRH1P35367 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HRH1P35367 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HRH1P35367 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HRH1P35367 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HRH1P35367 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HRH1P35367 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HRH1P35367 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HRH1P35367 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HRH1P35367 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HRH1P35367 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HRH1P35367 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HRH1P35367 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HRH1P35367 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HRH1P35367 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HRH1P35367 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HRH1P35367 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HRH1P35367 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HRH1P35367 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HRH1P35367 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HRH1P35367 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HRH1P35367 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HRH1P35367 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HRH1P35367 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HRH1P35367 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HRH1P35367 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HRH1P35367 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HRH1P35367 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HRH1P35367 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HRH1P35367 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HRH1P35367 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HRH1P35367 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HRH1P35367 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HRH1P35367 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HRH1P35367 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HRH1P35367 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HRH1P35367 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HRH1P35367 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HRH1P35367 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HRH1P35367 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HRH1P35367 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HRH1P35367 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HRH1P35367 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HRH1P35367 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HRH1P35367 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HRH1P35367 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HRH1P35367 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HRH1P35367 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HRH1P35367 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HRH1P35367 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HRH1P35367 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HRH1P35367 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HRH1P35367 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HRH1P35367 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HRH1P35367 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HRH1P35367 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HRH1P35367 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HRH1P35367 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HRH1P35367 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HRH1P35367 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HRH1P35367 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HRH1P35367 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HRH1P35367 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HRH1P35367 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HRH1P35367 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HRH1P35367 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HRH1P35367 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HRH1P35367 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HRH1P35367 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HRH1P35367 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HRH1P35367 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HRH1P35367 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms