Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCND3P30281 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCND3P30281 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCND3P30281 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCND3P30281 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCND3P30281 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCND3P30281 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCND3P30281 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCND3P30281 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCND3P30281 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCND3P30281 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCND3P30281 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCND3P30281 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCND3P30281 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCND3P30281 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCND3P30281 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCND3P30281 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCND3P30281 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCND3P30281 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCND3P30281 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCND3P30281 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCND3P30281 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCND3P30281 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCND3P30281 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCND3P30281 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCND3P30281 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCND3P30281 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCND3P30281 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCND3P30281 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCND3P30281 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCND3P30281 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCND3P30281 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCND3P30281 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCND3P30281 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCND3P30281 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCND3P30281 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCND3P30281 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCND3P30281 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCND3P30281 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCND3P30281 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCND3P30281 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCND3P30281 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCND3P30281 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCND3P30281 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCND3P30281 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCND3P30281 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCND3P30281 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCND3P30281 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCND3P30281 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCND3P30281 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCND3P30281 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCND3P30281 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCND3P30281 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCND3P30281 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCND3P30281 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCND3P30281 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCND3P30281 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCND3P30281 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCND3P30281 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCND3P30281 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCND3P30281 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCND3P30281 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCND3P30281 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCND3P30281 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCND3P30281 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCND3P30281 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCND3P30281 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCND3P30281 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCND3P30281 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCND3P30281 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCND3P30281 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCND3P30281 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCND3P30281 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCND3P30281 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCND3P30281 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCND3P30281 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCND3P30281 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCND3P30281 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCND3P30281 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCND3P30281 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCND3P30281 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCND3P30281 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCND3P30281 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCND3P30281 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCND3P30281 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCND3P30281 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCND3P30281 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCND3P30281 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCND3P30281 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCND3P30281 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCND3P30281 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCND3P30281 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCND3P30281 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCND3P30281 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCND3P30281 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCND3P30281 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCND3P30281 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCND3P30281 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCND3P30281 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCND3P30281 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms