Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK1P29120 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms