Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
IL3RAP26951 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3RAP26951 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3RAP26951 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3RAP26951 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3RAP26951 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3RAP26951 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3RAP26951 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3RAP26951 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3RAP26951 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3RAP26951 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3RAP26951 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms