Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRDP23468 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRDP23468 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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