Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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CXCL2P19875 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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CXCL2P19875 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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CXCL2P19875 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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CXCL2P19875 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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CXCL2P19875 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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CXCL2P19875 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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CXCL2P19875 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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CXCL2P19875 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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CXCL2P19875 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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CXCL2P19875 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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