Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD58P19256 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD58P19256 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD58P19256 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD58P19256 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD58P19256 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD58P19256 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD58P19256 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD58P19256 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD58P19256 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD58P19256 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD58P19256 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD58P19256 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD58P19256 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD58P19256 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD58P19256 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD58P19256 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD58P19256 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD58P19256 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD58P19256 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD58P19256 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD58P19256 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD58P19256 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD58P19256 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD58P19256 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD58P19256 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD58P19256 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD58P19256 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD58P19256 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD58P19256 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD58P19256 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD58P19256 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD58P19256 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD58P19256 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD58P19256 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD58P19256 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD58P19256 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD58P19256 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD58P19256 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD58P19256 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD58P19256 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD58P19256 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD58P19256 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD58P19256 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD58P19256 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD58P19256 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CD58P19256 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD58P19256 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD58P19256 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD58P19256 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD58P19256 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD58P19256 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD58P19256 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD58P19256 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CD58P19256 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD58P19256 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CD58P19256 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD58P19256 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD58P19256 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD58P19256 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD58P19256 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD58P19256 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD58P19256 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD58P19256 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD58P19256 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD58P19256 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD58P19256 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD58P19256 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD58P19256 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD58P19256 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CD58P19256 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD58P19256 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD58P19256 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD58P19256 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD58P19256 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD58P19256 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD58P19256 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD58P19256 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD58P19256 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD58P19256 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD58P19256 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD58P19256 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD58P19256 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD58P19256 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD58P19256 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CD58P19256 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD58P19256 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD58P19256 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD58P19256 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD58P19256 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD58P19256 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD58P19256 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD58P19256 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD58P19256 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD58P19256 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD58P19256 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD58P19256 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD58P19256 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD58P19256 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD58P19256 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms