Protein–RNA interactions for Protein: P16118

PFKFB1, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB1P16118 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PFKFB1P16118 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFKFB1P16118 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms