Protein–RNA interactions for Protein: P15172

MYOD1, Myoblast determination protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOD1P15172 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYOD1P15172 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MYOD1P15172 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms