Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BMP3P12645 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BMP3P12645 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BMP3P12645 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BMP3P12645 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BMP3P12645 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BMP3P12645 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BMP3P12645 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BMP3P12645 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BMP3P12645 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BMP3P12645 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BMP3P12645 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BMP3P12645 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BMP3P12645 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BMP3P12645 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BMP3P12645 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BMP3P12645 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BMP3P12645 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BMP3P12645 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BMP3P12645 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BMP3P12645 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BMP3P12645 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BMP3P12645 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BMP3P12645 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BMP3P12645 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BMP3P12645 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BMP3P12645 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BMP3P12645 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BMP3P12645 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BMP3P12645 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BMP3P12645 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BMP3P12645 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BMP3P12645 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BMP3P12645 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BMP3P12645 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BMP3P12645 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BMP3P12645 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BMP3P12645 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BMP3P12645 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BMP3P12645 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BMP3P12645 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BMP3P12645 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BMP3P12645 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BMP3P12645 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BMP3P12645 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BMP3P12645 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BMP3P12645 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BMP3P12645 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BMP3P12645 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BMP3P12645 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BMP3P12645 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BMP3P12645 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BMP3P12645 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BMP3P12645 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BMP3P12645 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BMP3P12645 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BMP3P12645 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BMP3P12645 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BMP3P12645 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BMP3P12645 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BMP3P12645 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BMP3P12645 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BMP3P12645 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BMP3P12645 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BMP3P12645 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BMP3P12645 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BMP3P12645 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BMP3P12645 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BMP3P12645 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BMP3P12645 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BMP3P12645 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BMP3P12645 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BMP3P12645 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BMP3P12645 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BMP3P12645 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BMP3P12645 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BMP3P12645 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BMP3P12645 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BMP3P12645 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BMP3P12645 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BMP3P12645 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BMP3P12645 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BMP3P12645 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BMP3P12645 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BMP3P12645 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BMP3P12645 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BMP3P12645 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BMP3P12645 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BMP3P12645 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BMP3P12645 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BMP3P12645 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BMP3P12645 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BMP3P12645 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BMP3P12645 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
BMP3P12645 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BMP3P12645 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BMP3P12645 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BMP3P12645 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BMP3P12645 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BMP3P12645 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms