Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
TOP2AP11388 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
TOP2AP11388 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.71
TOP2AP11388 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
TOP2AP11388 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
TOP2AP11388 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
TOP2AP11388 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
TOP2AP11388 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
TOP2AP11388 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
TOP2AP11388 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
TOP2AP11388 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
TOP2AP11388 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
TOP2AP11388 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
TOP2AP11388 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
TOP2AP11388 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
TOP2AP11388 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
TOP2AP11388 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
TOP2AP11388 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
TOP2AP11388 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
TOP2AP11388 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
TOP2AP11388 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
TOP2AP11388 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
TOP2AP11388 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC38.22■■■■□ 3.71
TOP2AP11388 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
TOP2AP11388 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
TOP2AP11388 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
TOP2AP11388 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC38.21■■■■□ 3.71
TOP2AP11388 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
TOP2AP11388 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
TOP2AP11388 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
TOP2AP11388 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
TOP2AP11388 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC38.2■■■■□ 3.71
TOP2AP11388 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
TOP2AP11388 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
TOP2AP11388 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
TOP2AP11388 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
TOP2AP11388 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
TOP2AP11388 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
TOP2AP11388 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
TOP2AP11388 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
TOP2AP11388 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
TOP2AP11388 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
TOP2AP11388 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
TOP2AP11388 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
TOP2AP11388 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
TOP2AP11388 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
TOP2AP11388 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
TOP2AP11388 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
TOP2AP11388 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
TOP2AP11388 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
TOP2AP11388 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
TOP2AP11388 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
TOP2AP11388 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
TOP2AP11388 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
TOP2AP11388 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
TOP2AP11388 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
TOP2AP11388 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
TOP2AP11388 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
TOP2AP11388 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
TOP2AP11388 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
TOP2AP11388 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
TOP2AP11388 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
TOP2AP11388 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
TOP2AP11388 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
TOP2AP11388 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
TOP2AP11388 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
TOP2AP11388 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
TOP2AP11388 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
TOP2AP11388 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
TOP2AP11388 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
TOP2AP11388 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.7
TOP2AP11388 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.69
TOP2AP11388 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
TOP2AP11388 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
TOP2AP11388 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
TOP2AP11388 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
TOP2AP11388 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
TOP2AP11388 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
TOP2AP11388 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
TOP2AP11388 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
TOP2AP11388 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC38.12■■■■□ 3.69
TOP2AP11388 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
TOP2AP11388 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
TOP2AP11388 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
TOP2AP11388 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
TOP2AP11388 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
TOP2AP11388 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
TOP2AP11388 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
TOP2AP11388 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC38.1■■■■□ 3.69
TOP2AP11388 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
TOP2AP11388 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
TOP2AP11388 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
TOP2AP11388 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
TOP2AP11388 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
TOP2AP11388 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
TOP2AP11388 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
TOP2AP11388 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
TOP2AP11388 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.7 ms