Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPRAP08240 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRPRAP08240 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms