Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HTATSF1O43719 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HTATSF1O43719 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms