Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCXO43602 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCXO43602 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCXO43602 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCXO43602 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCXO43602 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCXO43602 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCXO43602 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCXO43602 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCXO43602 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCXO43602 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCXO43602 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCXO43602 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCXO43602 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DCXO43602 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCXO43602 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCXO43602 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DCXO43602 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCXO43602 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCXO43602 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCXO43602 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCXO43602 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCXO43602 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCXO43602 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DCXO43602 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCXO43602 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCXO43602 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCXO43602 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCXO43602 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCXO43602 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DCXO43602 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCXO43602 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCXO43602 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCXO43602 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCXO43602 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DCXO43602 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCXO43602 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCXO43602 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCXO43602 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCXO43602 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCXO43602 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DCXO43602 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCXO43602 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCXO43602 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCXO43602 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCXO43602 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCXO43602 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCXO43602 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCXO43602 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCXO43602 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCXO43602 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCXO43602 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCXO43602 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCXO43602 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCXO43602 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCXO43602 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DCXO43602 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCXO43602 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCXO43602 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCXO43602 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCXO43602 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCXO43602 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCXO43602 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCXO43602 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DCXO43602 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCXO43602 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCXO43602 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCXO43602 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DCXO43602 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCXO43602 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCXO43602 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCXO43602 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCXO43602 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCXO43602 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCXO43602 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCXO43602 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCXO43602 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCXO43602 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCXO43602 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCXO43602 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCXO43602 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCXO43602 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DCXO43602 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCXO43602 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCXO43602 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DCXO43602 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCXO43602 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCXO43602 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCXO43602 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCXO43602 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCXO43602 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCXO43602 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCXO43602 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCXO43602 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCXO43602 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCXO43602 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCXO43602 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCXO43602 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCXO43602 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCXO43602 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms