Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
FOXO3O43524 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FOXO3O43524 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
FOXO3O43524 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
FOXO3O43524 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FOXO3O43524 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FOXO3O43524 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FOXO3O43524 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FOXO3O43524 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FOXO3O43524 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FOXO3O43524 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FOXO3O43524 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FOXO3O43524 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FOXO3O43524 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
FOXO3O43524 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FOXO3O43524 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FOXO3O43524 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FOXO3O43524 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FOXO3O43524 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FOXO3O43524 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FOXO3O43524 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FOXO3O43524 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FOXO3O43524 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FOXO3O43524 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FOXO3O43524 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FOXO3O43524 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FOXO3O43524 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FOXO3O43524 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
FOXO3O43524 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FOXO3O43524 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FOXO3O43524 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FOXO3O43524 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FOXO3O43524 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FOXO3O43524 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
FOXO3O43524 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
FOXO3O43524 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FOXO3O43524 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FOXO3O43524 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
FOXO3O43524 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms