Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCER2I3L3R5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCER2I3L3R5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms