Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BECN2A8MW95 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms