Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms