Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY7

CDV3, Protein CDV3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDV3Q9UKY7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDV3Q9UKY7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CDV3Q9UKY7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CDV3Q9UKY7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDV3Q9UKY7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDV3Q9UKY7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CDV3Q9UKY7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CDV3Q9UKY7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDV3Q9UKY7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDV3Q9UKY7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDV3Q9UKY7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDV3Q9UKY7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDV3Q9UKY7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDV3Q9UKY7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDV3Q9UKY7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDV3Q9UKY7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDV3Q9UKY7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDV3Q9UKY7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDV3Q9UKY7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDV3Q9UKY7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDV3Q9UKY7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDV3Q9UKY7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CDV3Q9UKY7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDV3Q9UKY7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDV3Q9UKY7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDV3Q9UKY7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDV3Q9UKY7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDV3Q9UKY7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDV3Q9UKY7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDV3Q9UKY7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDV3Q9UKY7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CDV3Q9UKY7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDV3Q9UKY7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDV3Q9UKY7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDV3Q9UKY7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDV3Q9UKY7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CDV3Q9UKY7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDV3Q9UKY7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDV3Q9UKY7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms