Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3BP4Q9P0V3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP4Q9P0V3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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