Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CXXC1Q9P0U4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXXC1Q9P0U4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms