Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms