Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms