Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ03

SCRT2, Transcriptional repressor scratch 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT2Q9NQ03 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRT2Q9NQ03 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms