Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms