Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1M0

NUP62CL, Nucleoporin-62 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62CLQ9H1M0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP62CLQ9H1M0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP62CLQ9H1M0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP62CLQ9H1M0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP62CLQ9H1M0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP62CLQ9H1M0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP62CLQ9H1M0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP62CLQ9H1M0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP62CLQ9H1M0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NUP62CLQ9H1M0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP62CLQ9H1M0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP62CLQ9H1M0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP62CLQ9H1M0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP62CLQ9H1M0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP62CLQ9H1M0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP62CLQ9H1M0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP62CLQ9H1M0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP62CLQ9H1M0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP62CLQ9H1M0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP62CLQ9H1M0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP62CLQ9H1M0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP62CLQ9H1M0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP62CLQ9H1M0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP62CLQ9H1M0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP62CLQ9H1M0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP62CLQ9H1M0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP62CLQ9H1M0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP62CLQ9H1M0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP62CLQ9H1M0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP62CLQ9H1M0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP62CLQ9H1M0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP62CLQ9H1M0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP62CLQ9H1M0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP62CLQ9H1M0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP62CLQ9H1M0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP62CLQ9H1M0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP62CLQ9H1M0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP62CLQ9H1M0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP62CLQ9H1M0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP62CLQ9H1M0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms