Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD1Q9GZZ0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms