Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SYCP2Q9BX26 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SYCP2Q9BX26 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms