Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWJ5

SF3B5, Splicing factor 3B subunit 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B5Q9BWJ5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms