Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP4Q9BWG4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms