Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SH3GL3Q99963 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3GL3Q99963 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3GL3Q99963 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3GL3Q99963 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3GL3Q99963 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3GL3Q99963 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3GL3Q99963 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3GL3Q99963 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3GL3Q99963 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3GL3Q99963 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3GL3Q99963 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3GL3Q99963 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3GL3Q99963 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3GL3Q99963 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3GL3Q99963 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3GL3Q99963 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3GL3Q99963 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3GL3Q99963 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3GL3Q99963 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3GL3Q99963 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3GL3Q99963 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3GL3Q99963 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3GL3Q99963 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3GL3Q99963 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3GL3Q99963 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3GL3Q99963 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3GL3Q99963 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3GL3Q99963 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3GL3Q99963 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3GL3Q99963 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms