Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms