Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNT1Q96Q11 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNT1Q96Q11 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms