Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD27Q96NW4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD27Q96NW4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms