Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG3

TTC25, Tetratricopeptide repeat protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC25Q96NG3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC25Q96NG3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC25Q96NG3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC25Q96NG3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC25Q96NG3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC25Q96NG3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC25Q96NG3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC25Q96NG3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC25Q96NG3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC25Q96NG3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC25Q96NG3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC25Q96NG3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC25Q96NG3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC25Q96NG3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC25Q96NG3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC25Q96NG3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC25Q96NG3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC25Q96NG3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC25Q96NG3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC25Q96NG3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC25Q96NG3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC25Q96NG3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC25Q96NG3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC25Q96NG3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC25Q96NG3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC25Q96NG3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC25Q96NG3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC25Q96NG3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC25Q96NG3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms