Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TVP23CQ96ET8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms