Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms