Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL29Q96CT2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KLHL29Q96CT2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms