Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOP1MTQ969P6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms