Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATRIPQ8WXE1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms